Esta etapa del viaje se enfoca en la transición entre la niñez y la adolescencia. Por eso, en Middle School, los estudiantes reciben un acompañamiento centrado en las necesidades de la preadolescencia para guiarlos a nivel académico, social, personal y cultural, apostando a un aprendizaje diferenciado. Además, se les brindan herramientas y habilidades necesarias que les permiten construir un camino sólido a las siguientes etapas de vida: Junior, Senior y, posteriormente, la Universidad.

En Middle School, se potencian los aprendizajes con abordajes de mayor profundidad, mediados por las nuevas tecnologías, e inicia el desarrollo del francés como tercera lengua. De esta manera, los estudiantes reciben 28 horas semanales en inglés, 10 en español y 2 en francés, aportando a la propuesta trilingüe del viaje educativo Jefferson y preparándolos como ciudadanos del mundo en un entorno multicultural. En esta sección, los estudiantes presentan su primera prueba Cambridge, que certifica su nivel de bilingüismo y evidencia su capacidad para mantener conversaciones largas y complejas.